به كتاب هاى كثيرالرجوع در هر رشته علمى، آثار مرجع گفته مى شود. در جلد مرجع شناسى از دانشنامه امام على(ع)، فقط كتاب هاى مرجع معرفى شده است. پاره اى از اين مراجع به تفصيل و در قالب يك مقاله معرفى گرديده است؛ از جمله: نهج البلاغه، غررالحكم و دررالكلم، صحيفه علويه و الغدير. پاره اى ديگر از كتاب ها، به اجمال و همگى ذيل عنوان «مرجع شناسى« شناسانده شده است. اين كتاب ها عبارتند از: اثبات الوصيه، الجمل، الغارات، الغدير فى التراث الاسلامى، المسترشد فى الامامه، المعيار و الموازنه، المناقب، اليقين، خصائص اميرالمؤمنين، دستور معالم الحكم، عمدة عيون صحاح الاخبار، غايةالمرام، كتاب سليم بن قيس، كفاية الطالب، مأة كلمة، مسند على بن ابى طالب(ع)، مسندالامام على(ع)، مشارق انواراليقين، مناقب على بن ابى طالب(ع)، موسوعة الامام على(ع)، نثراللآلى، وقعة صفين. در معرفى اين كتاب ها، به نويسندگان، درونمايه كتاب ها، نسخه هاى هر كتاب و ترجمه ها و شرح هاى آن پرداخته شده است.